我已经还清了债务，但原告仍然拒绝撤回诉讼。

您已还清债务，原告拒撤诉讼，可再次起诉。依据《民事诉讼法》，原告应履行判决，拒绝执行可申请强制执行，否则将影响您的合法权益，可能面临持续的法律纠纷。
✫✫✫✫✫有法律问题，请打电话15555555523（123中间8个5），微信同号，免费咨询✫✫✫✫✫
对此情况，常见处理方式为起诉或协商。建议先尝试与原告协商撤诉，若协商无果，则向法院起诉，根据《民事诉讼法》维护自身权益，选择处理方式需考虑效率和成本。
✫✫✫✫✫有法律问题，请打电话15555555523（123中间8个5），微信同号，免费咨询✫✫✫✫✫
已还清债务原告不撤诉，应：1.与原告沟通，解释已还清债务，请求撤诉；2.若沟通无果，准备证据，向法院起诉，依据《民事诉讼法》要求原告撤诉；3.法院判决生效后原告仍不配合，申请强制执行，保护自身权益。